空间医学讲病因是水，就是水多与少的问题。治疗过程也是一个调解水的过程，调合均匀水在体内的重新分布。因此，空间医学提出了一个治病总原则：清除污染，疏通河道，能量搬家，公转畅通。
1、清除污染
所谓污染可存在于细胞内部或细胞外的空间。无论是细胞内还是细胞外，一切的污染都源于体内水的污染。科学研究证实，人在诞生之前的受精卵状态，有99％是水；胎儿状态，有90％的成分是水；成人之后，水会降到70％；据推测，临死前水应该会降至50％。可以说，人是由水构成的。只有人体内部的水净洁、流通转化正常，人才能拥有健康。
体内的水污染与否也会直接体现在舌质与舌苔上。当体内空间的水没有被污染的时候，舌苔是一层薄白苔。这层薄苔不但是有胃气的象征，更是有卫气的象征。因为空间净洁的水捍卫细胞的开合，促进细胞的消化吸收。当空间“水”的浓度太浓，压力太大的时候，必定影响水在空间的流动，影响清升浊降。清升浊降是水在流动时进行自我过滤的过程，它提供各脏腑新陈代谢的营养物质，保证脏腑空间的湿润程度，保证人体津液的留存。
舌质有裂纹且干说明细胞缺乏水分，物质不运动。物质不动，则细胞内就象石头一样没有弹性，细胞的开合消化功能自然就减弱了，细胞内的物质难以转化成空间的能量，这就是临床上所看到的重病后期的镜面舌，传统讲因胃气不足而导致。当细胞内的水分渐渐浑浊而且在减少的时候，胞内的物质因缺乏动力使得细胞丧失了活力，即使重新注入水分，想要恢复细胞的功能就和把一台破旧的机器重新启动一样难。
有了污染的空间，如同流水中有了杂草一样。要想使水流通畅，水流的方向也就是能量运行的方向，能量所过之处，需要空间的清洁，否则容易在受阻处产生瘀滞，久之形成积患。因此，空间医学在治疗总原则上首选清除污染，就是要清理能量运行的环境和空间。只有给能量提供良好的运行空间，才能顺利地完成接下来的一系列环节，最后实现公转畅通，给治疗疾病提供了条件。因此，要想得到健康，就必须治理细胞生存的环境。只有洁净的空间，才有利于细胞的吞吐功能正常。
空间医学把人体比喻成一条环流的河。也可以把舌看作一条河，舌质代表河水，舌苔代表河流上方的水气，舌根是河水的发源地，河中是河水的流经地，舌尖是河水的入海口。舌中线代表公转的任脉段，两侧中线分别代表两肋的水气运行的路线。舌中线为主，舌两侧中线为辅。舌就好比是一个倒立的人体，舌的不同部位与人体的不同部位相对应。有六个基准点，以这六个点为基础寻找人体部位的对应点。这六个点是舌中线与舌上焦的交叉点——膻中；左右中线与上焦交叉点——左乳和右乳；舌中线与中焦的交叉点——肚脐；左右中线与中焦的交叉点——左右天枢。通过观察舌象，就可以对这条河的运行状况作出分析和判断。在具体观舌过程中，河道要无障碍，河流畅通无障碍，河水清洁见底，水气畅行无阻，不存在污染。也就是舌质分布要均匀，不存在明显的突起和凹陷，舌质淡红，舌苔薄白，如果不符合这一标准就要进行治理。所以，舌是空间医学诊断的依据，是治疗的依据，是分析病因病果的依据。
治疗疾病需要疏通水道，在清除污染的基础上，空间中的积聚受阻之处就显露出来。在一个河道中清除了杂草，就能看见河底成块的瘀泥了。顺着河流的方向，也就是公转的路线，再将这个瘀泥想办法运走。
2、疏通河道
人体的河道不单纯指人体的经脉，还包括细胞内部、血管、微循环以及人体的大小空间。疏通河道，就是清理河道上的障碍物——沉淀瘀滞，胞内之水的沉淀，胞内物质的沉淀。正常的情况下，舌质平坦，三山不高，平原不多，颜色淡红。但临床上发现，很多患者舌质凸凹不平。局部隆起或凹陷严重；或者看似平坦，暗藏点状突起；或者颜色暗紫等。这些情况都说明细胞内部存在水的沉淀，要加以疏通。治疗时，解决物质淤滞，要从能量入手，要寻找淤滞部位的前端。因为是前端不疏通，才造成后端的淤滞。癌症之聚，往往聚于成病的前方处，并非成病之处。人体的病和病因往往并不在一处。例如咳嗽，其病在肺，其因在外焦，在太阳区。在这种情况下，不要去管什么病，把前端挖低、让水一冲而过，就迎刃而解了。这是通过临床得到的结论。
另外，在疏通过程中，不可直接化瘀，要以行为主，要活水不去水，应用水自身的冲刷力化解瘀滞。要大量补充胞内水分，这和治理自然界的河流是同样的道理。如果要疏通河道，一定要有适当的水，如果水干枯了，就很难解决问题。水源充足，淤滞才能化解，河道才能疏通。临床中还有发现一种情况，即血沉于水。很多患者舌质淡白，呈缺血状，但事实并非如此。比如，败血症患者舌质淡白，看似缺血，往往采取补血的方法。事实上，败血症并不缺血，而是血不能够充分运转流通，形成瘀滞，而血瘀又被水掩盖了。在治疗的过程中，一方面要去水，但又不能完全撤掉。如果完全撤掉，就很难去除瘀血。只有借助水的推动力，才能解决。所以说：水行则化。要把沉在水底的血瘀化解开。应用佩兰，可以治水，如若不是腹泻，佩兰2克足矣。如果沉在水中的血瘀化不开，还要应用当归。传统本草认为，当归有生血、化血、活血的作用。实质就是当归能够解决沉在水底的瘀滞，用量2克为宜。癌症患者往往会出现“血沉于水”的情况，所以空间医学得出“清除水底之淤是治癌之妙法”。
河道的畅通无阻，给能量的通行打下了基础，提供了运行的空间。人类生存的关键就在于能量的流动和空间的畅通。日月星辰在天空上演着每一天，为的是反复照耀地球，以求得交相互映，这就是空间畅通的结果。否则天有乌云，挡住了空间，必然天昏地暗，人类生存在这样的环境结果可想而知。天人合一，人是小宇宙，人体内如果乌云密布，也如同河道淤泥淤积，则能量阻滞，引起疾病。所以，必须要有一个流动、畅通的空间，才能利于人体健康。细胞也要生存在流通的环境，方使细胞的消化吸收正常运转。所以，必须要清除河道中的不通之处，以便给能量搬家和公转畅通提供顺畅的空间。
3、能量搬家
能量搬家，一为物质转化为能量；二为高能量向低能量的流动。《内经》讲“气聚则成形，散则成风”。可见一切有形的物质积聚都与能量的积聚有关。要想化解物质的积聚，必须首先化解能量的积聚，空间医学主张化解的方法就是能量搬家。现代人正处在水深火热之中，正在遭遇一场灾难。因为现在的物质生活水平提高了，各种各样的营养品越来越多，人参、鹿茸、冬虫夏草等等，补脑的，补心的，补肺的，补肾的，补得物质都不能新陈代谢了，补得上焦部位能量壅阻，没有办法疏散。那么，改变的唯一办法就是能量搬家。《内经》讲“上病下取之，左病右取之”，讲五行运动，讲气血运动，这些都是能量搬家的典范。能量搬家究竟往什么地方搬？一定要保证下游的疏通、顺畅。古老传统文化指出了什么是下游，什么是上游。相生为下游，相克为上游。五行相生，肝的下游是心；木能生火，心的下游是脾；火能生土，脾的下游是肺。在临床过程中，掌握能量的这种变化，这就是正常的搬家。此外，人体能量的大循环能够带动人体整体运行。公转是人体风水的大运行，是净化四大空间的方法。公转正常运行，细胞内外物质与能量之间的转化才正常，脏腑功能才能正常。公转也是带动能量搬家最为有效的途径。
在能量搬家的过程中，不同的疾病会出现不同的反应。要解放思想，辩证地看待问题，正确地认识能量搬家。比方说，子宫肌瘤，开始时是3×2cm大小，治疗以后成为5×2 cm，这是明显的增大了。很多患者不理解，认为效果不理想，背上了心理包袱，甚至对治疗失去信心。不能单纯地看体积的大小，还要看中间的密度，3×2 cm是高密度，5×2 cm是低密度，这是观察疾病的关键。原来的肿物非常实，虽然小，但是不容易搬。后来的比较宣，只有宣起来，细胞之间有了空间，才有办法化解。
传统中医讲气血疏通，气血越疏通，就可能发生转移，不转移怎么能疏通呢？只要是有计划的转移，只要是有计划的疏通，就是正常的治疗。再如治疗结石，开始有一个，后来变成泥沙状；或者一开始是圆的，后来变成方的或者扁的。这些都是实体发生了变化，要解放思想，认识到本质，搬家必须使形体物质转化为能量。只有形体转化为能量，才有办法搬家。
《内经》讲“阴病治于阳，阳病治于阴。”人们往往只是理解字面的意思，其实阴病治于阳，阳病治于阴，就是能量大搬家。公转畅通了人体任督二脉的运行。任脉为诸阴经之汇，督脉为诸阳经之汇。空间医学发现了人体的外焦空间，并且通过疏散或者增加人体外焦空间的能量来调整人体的四焦，调整人体五脏六腑的功能运行。这也是阴病治于阳，阳病治于阴的实践典范，也是能量大搬家的过程。
一切疾病皆可用能量搬家法。在搬家过程中，一定要掌握：能量由高处向能量低处疏散；由下而上疏散；在观察舌的过程中，要掌握由舌根向舌尖的疏散。这和河流一样，从发源地向大海运行。舌尖就好比是入海口，要避免河流的堵塞，就必须保证入海口的畅通。所以，治疗要先疏通舌尖。舌尖代表着人体上中下三焦能量向外焦转化的通道。上中下三焦的能量只有越过肩达到外焦，与外焦的能量混化异化，才能实现能量的大融合，才能实现公转畅通及四焦循环畅通。
在治疗上，空间医学重视这个大融合。传统中医只是强调了清升浊降，强调了气血疏通，但是没有认识到大融合的作用。只有认识到大融合，认识到能量的大运动；只有把人体三焦能量都搬到人体的外焦，在外焦融合变化，才能解决人体的诸多疾病。而外焦能量撞击肾部细胞，增强肾区空间能量，才能增强人体的原动力。
观舌诊断，可以不用受心肝肺等分区的影响。一个舌头从舌根看，是河的发源地，向舌尖流水，舌尖是入大海的入海口，把舌看做是一个河道。这个河道是从舌根到舌尖，从舌尖这个入海口，流入大海，也就是注入外焦空间。进入大海后，就可以不管了。舌尖部是舌根能量的补给基础，也就是舌尖的瘀滞与舌根有关系。如果舌根的舌苔很高，传统中医讲的元气不足，这种情况下，要把舌尖的能量导引至下焦，是金生水。舌根是河的发源地，舌根的苔厚，大海的水就流不到发源地，整个舌头就没有水了。所以，舌根很厚，要把厚的地方向前移，向前移就是把前面挖空挖低，舌根的水就向前流，舌根就低了。
舌中心很高，舌根也很高，这种情况下，就不能搬舌根的能量。因为搬到舌中间，舌中间更高，所以要先搬舌中间，把舌中间的能量向舌尖般，这样能量则自行向前流动。
舌尖也很厚，舌中也很厚，这种情况下，一定不要把舌中间的搬到舌尖，会增加舌尖的瘀滞，水就更流不出去了，因此，要先掏空舌尖。如何掏空舌尖？把舌尖瘀滞的能量往大海转移，也就是把内焦能量导引至外焦天外天，如此一来上下就疏通了，这是治疗的关键。有什么病，哪个脏腑有病都不去管，只要舌根的搬到舌中间，舌中间的搬到舌尖，舌尖的搬到大海。先搬至高点，上焦高下焦也高，先搬上焦高的；中焦高下焦也高，先管中间高的。在治疗上就遵循这个原则。
空间医学药物的运行也是能量搬家，从运行的起点把能量带到运行的终点。所以空间医学的用药，小方的精细，就在于如何运用和搬运能量。如果上焦隆起，可用瓜蒌仁进行能量搬家。瓜蒌仁起点在上焦，终点在下焦。瓜蒌仁可以把肺区的能量搬运到下焦，这适用于上实下虚的舌象，临床中有很多这样的舌象。香附可越膈而上，即，香附能把膈下的能量搬运到膻中部位，从而减轻了中焦压力。能量搬运到膻中部位，对于中焦是泻，对上焦是补。所以，香附能填补膻中部位能量的不足，治疗因膻中部位能量不足引起的幻听、幻象等精神类疾病，具有安神定志的作用。很多的疾病都是由于舌根的痈满引起的，如肾癌，前列腺癌等。可用香附把中间的能量向上推，中间空，下面的能量就往中间疏散，这就是能量搬家。
每一味药在进行能量搬家的过程中，因为能量的转移变动，使机体内部发生了转机。对于能量匮乏之处和壅满之处来说，是互利的。从整体看没有增加能量，也没有耗损能量，只是在公转基础上的重新的按需分配罢了。所以，一味药的运用，在使能量重新分配的过程中，对人体所产生的作用，充分体现了一药治多病的原理。
4、公转畅通
如果把人体视为小宇宙，那么人体内部就是个大空间，能量在这大空间中进行大循环、大撞击，并且在大撞击中进行大交合。在自然界，天地之间本来就存在着大空间、大循环、大交合，由此才引起了天地之间的大变化，对人体也产生了各种影响。
人体内是个能量自由运动的空间，而且是不可分割的整体空间的能量运动，不能把整体空间的运动人为、机械地分割开来。只有促进人体内部形成整体运动，才是祛病强身的好方法。在治疗过程中，应根据身体素质状况，处理好局部和整体的关系，既使局部服从整体，又让整体照顾局部。
人体是一能量动力循环系统，包括自转与公转两个方面。
自转，即人体每一个细胞都在进行着胞内物质与胞外能量的相互转化，其所辐射的能量围绕在细胞本体周围。这种能量运行遵循着一定的规律，即自左向右围绕细胞本体运行，是横向水平面的运行。这种能量运行为自转。人体的脏腑均由细胞构成，脏腑的能量也都围绕脏腑本体进行自左向右的运行。
公转，即人体内能量的高度集中统一运行，牵动人体内部所有自转的运行，贯穿于人体四大空间。以传统中医的穴位进行标识，公转的运行路线如下：能量从会阴向上走，经丹田、中脘、膻中、天突，到达百会，向后方下行，经哑门、大椎、命门，过尾闾至会阴，再转向前方上行，循环往复。公转贯穿于人体的诸经，贯穿于血海、脑髓之海、气海、水谷之海，能量在四大海中进行交合、混化、异化，从而生成了新的物质能量。
道家有周天修炼法，公转路线经过了周天的各个部位，但很多方面有所不同。公转路线与佛家讲的海底轮、脐轮、腹轮、心轮、喉轮、眉心轮、顶轮相切。相切的交点是人体能量横向与纵向运行的交叉点，是能量的汇聚之处，是经与络能量的转换处，是公转与自转的调节处。所以，公转已经包含了道家和佛家的基本练法。公转在运行过程中调节脏腑的能量盈缺，对人体阴阳进行了综合性的调整。
传统中医有任督二脉，任脉为诸阴经之汇，督脉为诸阳经之汇。人体诸阴经的总调节机关是任脉，人体诸阳经的总调节机关是督脉。公转将任督两条经脉贯穿，统一调节阴阳。公转与传统中医所讲的任督二脉既有联系又有区别：其一，任脉和督脉是两条经脉，公转加强了任督两条经脉的贯通。其二，按照中医的说法，任脉的能量下行，督脉的能量上行。但公转任脉段的能量上行，督脉段能量下行。其三，公转路线宽度要远远大于两条经脉。在任脉段上，以任脉为中线，左右各拓宽二寸。在督脉段上，以督脉为中线，左右各拓宽二寸，即脊椎与五脏六腑之间的空间。任脉是诸阴之汇，督脉为诸阳之汇，公转加强任督二脉的贯通，使人体的诸阴经与诸阳经协调统一运行。
人体是一个开放型的动力体系，在体内大小不同的动力体系的相互刺激、撞击及相互推动下，形成并维系了人体的生命活力。人体的动力体系，小至细胞，大至各细胞群，借助不同层面的刺激，推动能量的相互变化、辐射、撞击与交融，并在相互交融中，产生新的能量物质。
公转，将人体的膻中动力、命门动力、会阴动力、膈膜动力相互连结、贯穿起来。因此。公转是人体动力体系的超级链接。
细胞与细胞之间存在着空间，能量的积聚、流通、异化、混化均在空间内产生，空间是生命物质活力的调节媒介。空间医学认识到：探讨病因必须找出空间通道受阻之处。
公转，贯穿、连结了人体的四大空间，是人体动力的循环系统，是一动力体系的超级链接。公转的畅通，带动了四大空间能量的周流，并使空间受阻、瘀滞的高能量在运行中自行参与混化、异化，并自然得到消散。公转畅通，调整、净化、启动能量运动，带动了人体能量的周流。换言之，人体致病的关键，与公转的运行受阻有关，是以引发空间物质、能量连锁效应的瘀滞与阻塞。
外焦空间是人体最大的空间，它主宰和调控三焦空间能量的运行、交合、分配和更新。外焦位于太阳区脊背的内侧，内则联系三焦，是三焦出入之大通道，故一切疾病的根源在于外焦区内。当外焦空间能量瘀滞不通，外焦在撞击力不足的情况下，将无以引发命门区域撞击尾闾进行刺激、推动会阴周围空间能量的向上推动力，因而致生出空间能量的瘀滞现象。
换言之，人体致病的关键，在于外焦运行力不足，引发了下、中、上三焦生化功能失调所致。公转畅通，不仅是治疗所有疾病的根本，也是快速由病理转为生理使人体恢复健康的不二法门。
传统医学应用了发表、化痰止咳平喘、清热、泻下、消导、芳香化湿、利水渗湿、袪风湿、温里、理气、理血等药性，做为调节病理的方法。亦即，通过不同的方法，将不能再被循环利用及多余的能量与物质，以不同途径排出体外。当这些不被人体再循环利用、多余的能量和物质排出体外时，也是病理转为正常生理的变化过程。例如发烧，是多余不被人体所需的能量，通过腠理发表、散出体外；腹泻现象，是将积食不化的糟泊浊物，排出体外；泻水者，是为清除肠胃多余的水气，唯有将多余水气清除，才有利于脾升清、胃降浊的功能活动力。病理转为正常生理的过程变化中，因腹泻、发汗、发烧及痰多等这样或那样的不适感，是为退病现象，是病理转为正常生理过程的变化。正如能量河道出口受阻，能量出口因而改变河道，河道的改道，是以引发不适的病症。治疗疾病，好比为疏通受阻不通的河道，将能量出口导引回正常的河道。疏通时，将随着受阻的程度与时间，而出现不同的变化。病源深入体内，年限已久者，彷佛是一潭不流通的死水，生虫长菌、腐臭情形可想而知。在疏通时，必须将这些浊废物清除于体外。浊废物清除排放，是为退病现象。换言之，每经历一次退病时的现象，象征、反应了病理向生理的转化与退病的层面。
空间医学通过临床，将退病层面总结区分为表、中、里三个层次。
表，是指表层，如腠理与肌理间的浊废物，通过发、清的途径排出体外。一般而言，是以发表腠理与肌理间的风寒湿热为主。
中，是指肌理与脏腑间的浊废物，通过清、化、利、渗、泻的途径排出体外。一般而言，是以净化脏腑的空间为主，将糟泊、浊废物及多余的水气，通过泻下、痰、大小二便的方式排出体外。
里，是指脏腑深层而言，通过理、转的途径加以调整及进行转化。一般而言，是以调节各细胞群的浓度与压力。
也就是说，表、中、里，通过了发、清、化、利、渗、泻、理、转，将不被人体再循环利用、多余的能量和物质排出体外，这就是病理转为正常生理变化的途径。
发：将表层风寒湿热之能量及水，从腠理发表出来，及将肌理的水输布于体表。
清：是指把腠理与肌理间的余热排放出来，如发烧、发冷。
化：是指化痰、化湿而言。脾、肺部的水气，通常体现于化痰。
利：是指利水，将过多的水排出。多见于两肾、膀胱患者。
渗：是指回流，将胞外能量渗入胞内，利、渗，常见于肿胀现象。
泻：泻下多见于物质过剩，肠胃积实不化者。
理：是指理气、理血。如止咳平喘、散血瘀血块。
转：是指细胞群胞内能量与物质，调节能量浓度压力，与胞内外的相互转化。常见于酸痛现象。
清升降浊：清升通过肺表于外，开窍如汗、眼屎、泪、痰；降浊如大小二便。
公转畅通，是以同时进行发、清、化、利、渗、泻、理、转的功能调节，畅通公转时，在能量高速度运行之下高低不同浓度压力的能量，将相互参与其中，进行能量的混化、异化。因能量的相互均衡及公转运行的带动下，首先调节各细胞群胞内能量与物质，能量浓度压力，及胞内外的相互转化。是以深层的能量运动，加速净化脏腑内外大小空间的能量，及刺激、推动肌理与腠理之能量与水气排于体表外。即，公转畅通是同时疏通表中里层大小空间的河道。因此，将同时出现不同层面的退病现象。不同于传统医学的从表层循序渐进的往中、里层逐步地转为正常生理的调节方法。
